Являясь одним из самых эффективных методов обследования, колоноскопия позволяет подробно изучить слизистую оболочку всего кишечника на протяжении всех его пяти футов. Для нее обычно используется значительно более длинный гибкий фиброоптический инструмент с системой подсветки и прямой трансляции изображения, который протягивается вдоль всего кишечника, по всем его складкам и изгибам, до слепой кишки. В руках квалифицированного специалиста она позволяет идентифицировать более 95% раковых и доброкачественных новообразований.

Кроме того, колоноскоп может выполнить и другую задачу. Так как внутри он полый, вместе с ним можно ввести и хирургический инструмент, чтобы сделать биопсию или удалить полипы, встретившиеся на его пути.

Слишком сложная и слишком дорогостоящая процедура, чтобы использовать ее при обычных плановых обследованиях, колоноскопия обычно предписывается только после других анализов и обследований или только людям, относящимся к группе высокого риска развития рака кишечника. К подготовительным процедурам, проводимым накануне обследования, обычно относится употребление жидкой пищи в течение дня, предшествующего обследованию, и прием вечером специального соляного раствора для того, чтобы очистить весь кишечник. Колоноскопия обычно проводится под воздействием успокаивающих средств в медицинском учреждении или в больнице в амбулаторных условиях.